Разом вони кілька років вирушали у паломництво до святих місць Палестини, Константинополя, Афону, жили в скиту поблизу річки Сорко.
Ставши в духовному житті досвідченим ченцем, преподобний Інокентій Комельскій протягом тридцяти років працював над створенням чернечої обителі в комельскому лісі, поблизу річки Їжа в Вологодському краї.
В основу життя монастирської братії він поклав євангельську заповідь любові й духовного світу.